Cromatografía en análisis multiresiduos de plaguicidas
Si formas parte de la cadena agroexportadora, sabes que el análisis de residuos no es solo un requisito documental. Es una herramienta para tomar decisiones con presión de tiempo, auditorías, mercados distintos y tolerancia mínima al error.
En ese escenario, el análisis multiresiduos de plaguicidas cobra un rol central porque permite detectar y cuantificar múltiples moléculas en una sola muestra de fruta o verdura. Además, muchos programas regulatorios y comerciales trabajan alrededor de niveles muy bajos; por ejemplo, la Comisión Europea indica que, cuando un plaguicida no está específicamente contemplado en una combinación sustancia-producto, aplica un límite general por defecto de 0,01 mg/kg en el marco de sus MRL. Comisión Europea, “EU legislation on MRLs”
Aquí es donde la cromatografía líquida (LC-MS/MS) y la cromatografía gaseosa (GC-MS/MS) dejan de ser términos de laboratorio para convertirse en herramientas concretas de gestión de calidad.
El análisis multiresiduos y su importancia en frutas y verduras
El análisis multiresiduos busca detectar y cuantificar residuos de plaguicidas en una sola muestra. Esto importa especialmente en frutas y verduras porque una misma matriz puede contener residuos con comportamientos químicos muy distintos y, además, los mercados de destino evalúan el cumplimiento frente a límites máximos de residuos definidos por regulación. En la Unión Europea, el Reglamento (CE) 396/2005 establece esos límites. Por eso, el análisis multiresiduos no es solo amplitud de cobertura: también es sensibilidad, validez del método y capacidad de responder a exigencias regulatorias
Eso importa mucho en frutas y verduras porque no todas las matrices se comportan igual. Una muestra de hoja verde, una uva, un mango o un cítrico no generan el mismo nivel de interferencias durante el análisis. La FAO (Food and Agriculture Administration) explica que el comportamiento de los residuos en alimentos depende de la naturaleza del pesticida y de la composición del producto vegetal, lo que afecta extracción, persistencia e interpretación. FAO, “Submission and evaluation of pesticide residues data”
¿Qué es la cromatografía y cuáles son las dos técnicas más usadas?
La cromatografía es una técnica que separa los compuestos presentes en una muestra para poder identificarlos y cuantificarlos por separado. En el análisis de plaguicidas, esa separación se combina con la espectrometría de masas en tándem, también llamada técnica masa-masa o MS/MS. El equipo primero selecciona la “masa” del compuesto que quiere estudiar, después lo fragmenta y finalmente analiza esos fragmentos. Esa secuencia ayuda a diferenciar mejor una molécula de otras parecidas y a medirla a concentraciones muy bajas.
La guía SANTE de la Comisión Europea reconoce el uso rutinario de LC (Cromatografía Líquida) y GC (Cromatografía Gaseosa) acopladas a MS/MS en residuos de plaguicidas. SANTE, “Analytical quality control and method validation procedures”
No todos los plaguicidas se separan ni se detectan de la misma manera, el manual de La FDA (Food and Drug Administration) indica que la cromatografía gaseosa es apropiada para compuestos que pueden vaporizarse a temperaturas cercanas a 250 °C sin degradarse, mientras que la cromatografía líquida resulta más apropiada para compuestos termolábiles o con un comportamiento menos favorable en fase gaseosa.
Dicho de forma simple: se necesitan dos rutas analíticas porque el universo de moléculas a controlar es químicamente diverso.
La cromatografía líquida LC-MS/MS suele emplearse para compuestos polares, menos volátiles o termolábiles, es decir, sustancias que podrían degradarse si se someten a altas temperaturas. Algunas moléculas de pesticidas que se analizan son: acetamiprid, carbendazim y dimetoato. Una revisión en TrAC Trends in Analytical Chemistry destaca precisamente el valor de LC-MS/MS para este tipo de residuos y su sensibilidad en matrices complejas. Lehotay et al., TrAC
La cromatografía gaseosa GC-MS/MS, en cambio, suele ser más adecuada para compuestos volátiles, semivolátiles o más afines a un análisis en fase gaseosa. Algunas moléculas de pesticidas que se analizan son: chlorpyrifos, cypermethrin y trifluralin. Una revisión en Journal of Chromatography A describe su utilidad en el análisis confirmatorio de residuos de plaguicidas y su buen desempeño para determinados grupos de compuestos. Pico et al., Journal of Chromatography A
LC y GC no compiten; se complementan. Justamente por la diversidad fisicoquímica de los plaguicidas, un solo sistema rara vez cubre con robustez todo el universo de moléculas relevantes.
La importancia de la lectura por doble técnica
La lectura por doble técnica tiene un valor práctico muy importante para el cliente. No se trata de “duplicar” el análisis sin motivo, sino de ampliar la cobertura y mejorar la interpretación del resultado.
El propio método de AOAC INTERNATIONAL indica que, tras la extracción y la limpieza, el extracto final se lleva de forma concurrente a GC/MS y LC/MS/MS para identificar y determinar un amplio rango de residuos; y la FDA señala que sus laboratorios usan un método armonizado multiresiduos basado en QuEChERS modificado más GC-MS/MS y LC-MS/MS.
La confiabilidad del dato, además, no depende solo del equipo: la guía SANTE se apoya en ISO/IEC 17025, y la Organización Internacional de Normalización define esta norma como el marco para demostrar la competencia, la imparcialidad y la operación consistente del laboratorio.
Cuadro 1: Moléculas analizadas con Cromatografía Líquida

Fuente: EURL-SRM
Cuadro 2: Moléculas analizados con Cromatografía Gaseosa

Fuente: EURL-SRM
El método QuEChERS: base del análisis multiresiduo
El método QuEChERS, una de las bases más usadas en análisis multiresiduos. El método oficial AOAC 2007.01 describe una lógica clara: extracción con acetonitrilo, partición con sales, limpieza por dispersive‑SPE y análisis final por GC/MS y LC/MS/MS. Este método es ampliamente utilizado para frutas y verduras.
Figura 1: Proceso del Método QueChERS en Análisis de Multiresiduos de Plaguicidas en Alimentos

Fuente: Elaboración propia
¿Qué es el efecto matriz y cuál es su importancia en el análisis multiresiduos?
El efecto matriz ocurre cuando componentes naturales de la muestra influyen en la medición del plaguicida. La guía SANTE lo define como la influencia de compuestos coextraídos sobre la medición del analito, este fenómeno es frecuente tanto en GC como en LC. Eso significa que azúcares, pigmentos, ceras, aceites esenciales, ácidos orgánicos u otras sustancias propias de la fruta o la verdura pueden hacer que la señal analítica suba o baje. No es un detalle menor: puede modificar la cuantificación si el método no está bien compensado.
Después de la extracción, el laboratorio realiza una limpieza del extracto para reducir interferencias de matriz. Esto es crítico porque frutas y verduras contienen azúcares, ácidos orgánicos, pigmentos y otros compuestos que pueden alterar la respuesta instrumental. La guía SANTE advierte que el efecto matriz es frecuente tanto en GC como en LC y debe evaluarse durante la validación del método. SANTE
Por eso la literatura técnica insiste en estrategias como calibración en matriz, uso de estándares internos y validación cuidadosa. Una revisión en Foods refuerza precisamente que el efecto matriz impacta linealidad, exactitud, precisión y límites de detección en análisis multirresiduo por LC-MS. Foods, revisión sobre matrix effect
¿Qué aporta a la gestión de calidad y al control del riesgo?
La cromatografía no es valiosa solo porque “detecta”. Es valiosa porque ayuda a responder preguntas de gestión:
1. ¿Qué moléculas están presentes?
La separación cromatográfica más la confirmación por masas permite distinguir compuestos específicos incluso dentro de matrices complejas. SANTE
2. ¿En qué concentración están?
Eso permite comparar el resultado con el MRL aplicable al mercado destino, no solo con una referencia local. La Comisión Europea y la FDA trabajan justamente sobre ese enfoque de cumplimiento con límites regulatorios. Comisión Europea MRLFDA PAM
En otras palabras, la cromatografía bien aplicada no elimina el riesgo comercial, pero sí mejora la calidad de la información con la que se gestiona ese riesgo.
Cuando el análisis multiresiduo se entiende solo como un requisito, suele verse como un costo. Pero cuando se entiende desde la gestión de calidad, se vuelve una fuente de información crítica para decidir mejor.
La cromatografía líquida y gaseosa cumplen justamente ese papel: aportar datos más robustos para interpretar residuos en frutas y verduras dentro de un entorno regulatorio exigente.
Si estás revisando cómo fortalecer tu estrategia de control de residuos según cultivo, matriz y mercado de destino, una asesoría técnica puede ayudarte a definir mejor qué enfoque analítico conviene evaluar.
Para más información sobre análisis multiresiduos de pesticidas escríbenos al correo: info.peru@normecgroup.com
Fuente:
- European Commission. EU legislation on MRLs. Comisión Europea.
- European Commission.Analytical quality control and method validation procedures for pesticide residues analysis in food and feed
- Codex Alimentarius.Guidelines on performance criteria for methods of analysis for the determination of pesticide residues in food and feed (CXG 90-2017).
- Codex Alimentarius.Recommended methods of sampling for the determination of pesticide residues for compliance with MRLs (CAC/GL 33-1999).
- FAO.Submission and evaluation of pesticide residues data for the estimation of maximum residue levels in food and feed.
- CEN.EN 15662:2018 Foods of plant origin — Multimethod for the determination of pesticide residues.
- AOAC International.Official Methods of Analysis.
- AOAC International.Official Method 2007.01 (QuEChERS).
- Lehotay, S. J. et al.LC-MS/MS in pesticide residue analysis.TrAC Trends in Analytical Chemistry.
- Pico, Y. et al.GC-MS/MS in pesticide residue analysis.Journal of Chromatography A.
- FDA.Pesticide Analytical Manual (PAM).
- ISO.ISO/IEC 17025.
- Eurachem/CITAC.Use of uncertainty information in compliance assessment.


